Superlink@Technion

Superlink@Technion — BOINC-проект распределенных вычислений, помогающий генетикам диагностировать наследственные заболевания человека путем анализа взаимного расположения генов в группах сцепления на хромосомах.

Superlink@Technion — проект генетических исследований Лаборатории компьютерной биологии (Laboratory of Computational Biology) Техниона - Технологического университета Израиля (Technion – Israel Institute of Technology) и Университета Висконсина в Мэдисоне (University of Wisconsin in Madison). С помощью портала Superlink Online эти организации предоставляют исходные данные для загрузки проекта вычислениями. Расчетный клиент для проекта Superlink@Technion создан на основе известной программы для генетических исследований Superlink.

Хромосомы — нитевидные молекулы ДНК в ядре клетки, закручивающиеся в виде двойной спирали. Хромосомы обеспечивают хранение, передачу из поколения в поколение и реализацию наследственной информации в виде генов. В ядре каждой клетки человеческого организма (кроме гамет) содержится 46 хромосом (23 материнских и 23 отцовских). Хромосомы воспроизводят свои точные копии в процессе деления клетки.

Каждый ген представляет собой отдельный участок хромосомы и содержит информацию о строении одной из молекул белка или РНК, во многом определяющих развитие и функционирование организма. На каждой хромосоме линейно располагается множество генов, которые передаются из поколения в поколение совместно, образуя группы сцепления по числу пар хромосом. У человека 23-м парам хромосом соответствует 23 группы сцепления генов.

Возмущения в картину сцепленного наследования генов вносит процесс перекрестного обмена участками хромосом при делении клеток — кроссинговер или перекрёст. Чем дальше друг от друга расположены гены в хромосоме, тем меньше между ними сцепление и тем чаще они разделяются при перекрёсте. И наоборот, чем ближе гены друг к другу на хромосоме, тем сильнее сцепление между ними и тем реже осуществляется кроссинговер. Эта закономерность — основа для определения расстояния между генами на хромосоме, таким образом ученые строят генетические карты хромосом.

Генетическая карта — это схема взаимного расположения генов, находящихся в одной группе сцепления. Детальные генетические карты человека — прекрасный инструмент для медицины и здравоохранения. Информация о локализации (точном расположении) генов на определенной хромосоме используется для диагностики наследственных заболеваний человека. Это как раз то, чем занимается проект Superlink@Technion — изучает взаимное расположение определенных генов на генетических картах, чтобы научиться выявлять наследственные болезни человеческого организма.

Как присоединиться к проекту Superlink@Technion

Вы тоже можете участвовать в проекте Superlink@Technion. Для этого скачайте последнюю версию BOINC-менеджера - это универсальная программа для участия в распределенных вычислениях. Установите BOINC: инструкцию как это сделать вы найдете в этом разделе. Запустите BOINC и войдите в режим Advanced View. Найдите в меню «Сервис» пункт «Добавить проект». В появившемся окне «Выбор проекта» скопируйте в поле «Адрес (URL)» следующую ссылку: http://cbl-boinc-server2.cs.technion.ac.il/superlinkattechnion/ После этого BOINC предложит создать учетную запись — введите адрес своего работающего электронного ящика и пароль. Пойдет загрузка файлов проекта, а по ее завершении начнутся вычисления. Поздравляем с присоединением к миру распределенных вычислений и проекту Superlink@Technion!

Не забудьте потом посетить свою учетную запись и стать участником одной из команд. Если у вас возникнут вопросы, зарегистрируйтесь на нашем форуме и задайте их.

Ссылки


pro/superlink.txt · Последние изменения: 2009-05-06 14:59 RM
Personal Tools